Große Datenbankgröße

Kann mir jemand sagen, warum ich zwei Websites habe, die über ein halbes Jahr alt sind, eine auf Joomla und eine selbstgeschriebene, mit Datenbanken von 5 und 10 MB, während diese leere Website 1378 MB groß ist? Der Hosting-Anbieter hat geantwortet: "Das liegt daran, dass die Tabellen der Datenbank vlanto_autprof den Typ InnoDB haben, während die beiden anderen Datenbanken MyISAM verwenden." Ist das wirklich ein normaler Unterschied, und kann man das irgendwie beheben?