rel="canonical" コードの重複

このバグはどう直せばよいか教えてください。コンテンツ分析ツールはどれもこれに警告を出します。また、原因は不明ですが、保存時に canonical アドレスが例えば /vasya になったり、ときには index.php/petya のようになったりすることもあります。metatag モジュールを入れています。設定では特に変わったことはしていないつもりです。今のところ robots.txt で例えば /index.php/v* のようなページをすべて閉じました。この対処で正しいでしょうか?