Tamaño grande de la base de datos

¿Me puedes decir, Iván, por qué tengo dos sitios que tienen seis meses o más, uno en Joomla y otro con una base de datos personalizada de 5 y 10 MB, y este vacío tiene 1378 MB? En el hosting me respondieron: "Esto se debe a que las tablas de la base de datos vlanto_autprof tienen tipo InnoDB, mientras que las otras dos bases de datos utilizan MyISAM." ¿Es realmente una diferencia normal? ¿Y se puede corregir de alguna manera?